ההבדל העיקרי בין הרפואה הסינית לרפואה המערבית מתחיל בתפיסת גוף האדם והבנתו:
הרפואה המערבית מתרכזת בסימפטומים ובאיבר הכואב- אם כואב הראש הבעיה היא בראש, אם כואבת הבטן הבעיה היא בבטן וכדומה. הנטייה המערבית היא לחפש פתרונות מהירים שירגיעו את הסימפטום/כאב החיצוני. לעומתה הרפואה הסינית מעמיקה לחפש ולאבחן את מקור הבעיה– היכן ומדוע הופר האיזון בגופנו. בדרך זו ניתן למצוא את שורש הבעיה- חוט מקשר בין סימפטומים שונים לחלוטין. היה ומצאנו וטיפלנו בשורש הבעיה, ייעלמו כל הסימפטומים הנובעים ממנו. כלומר "תפסנו שתי ציפורים במכה אחת" (ברוב המקרים אף יותר משתיים).
לדוגמה: אנשים השרויים בסטרס ממושך בד"כ יסבלו מבעיות שונות כגון: מתח וכאב בצוואר ושכמות, כאבי ראש-מיגרנה, אי סדירות מחזור, P.M.S, הפרעות עיכול- מעי רגיז, עצירות, הפרעת שינה, חולשה ועייפות, בעיות עור שונות כגון: פסוריאזיס, סבוריאה/ דרמטיטיס, הצטננות כרונית, נשירת שיער ועוד. הרפואה המערבית מפנה חולים אלה למס' רופאים מומחים שונים. כל רופא יתמקד בבעיה הספציפית בה מתמחה ויתן תרופות להקלה בסימפטום עליו מתלונן המטופל לדוגמא: כדורים לשיכוך כאבים, הורמונים להסדרת מחזור, לכסניות להפחתת חומציות בקיבה, כדורים לשינה, אנטיביוטיקה להתקררות, משחות קורטיזון לעור וכדומה. מבלי לחשוב על הקשר בין הבעיות השונות ומבלי להתחשב בכך שלהרבה מן התרופות הנ"ל יש תופעות לוואי המזיקות לכבד, לכליות, לקיבה, לעצמות, לקרישת הדם ועוד.
לעומת זה הרפואה הסינית מטפלת בבעיות אלה בצורה טבעית וללא תופעות לוואי.
הטיפול הסיני מתמקד בשורש הבעיה – בחוסר האיזון שנגרם בגופנו, כך נפתרות בעיות שונות הקשורות לאותו שורש בעיה. בדרך זו גם מתחזק גופנו ולומד כיצד להתמודד בעצמו עם מחלות שונות מבלי להיות תלוי בתרופות.
במקרים בהם לא ניתן להשתמש בתרופות וכדורים, כדוגמת: הורמונים לתופעות גיל המעבר לנשים שיש להן נטייה תורשתית לסרטן, תרופות שונות במהלך ההריון, אנשים המתקשים לבלוע כדורים עקב בחילה עזה וכדומה), הרפואה הסינית מהווה תחליף מצויין. במקרים מסוימים הרפואה הסינית אף משמשת תחליף לניתוחים, כדוגמת: צניחת רחם, בריחת שתן, בעיות ברכיים שונות ועוד.